- JR東日本 東海道本線 (東京～熱海) [正式区間]
- JR東日本 東海道本線 (東京～熱海) [運行系統]
- JR東日本 東海道本線 (品鶴線) [正式区間]
- JR東日本 横須賀線・総武線快速 (直通線) [運行系統]
- JR東日本 湘南新宿ライン [運行系統]
- JR東日本 相鉄・JR直通線 (大崎～羽沢横浜国大) [運行系統]
- JR東日本 山手線 [運行系統]
- JR東日本 赤羽線 [正式区間]
- JR東日本 南武線
- JR東日本 武蔵野線
- JR東日本 横浜線
- JR東日本 中央本線 (神田～代々木) [正式区間]
- JR東日本 中央線・総武線各駅停車 [運行系統]
- JR東日本 中央本線 (新宿～塩尻) [正式区間]
- JR東日本 中央線快速 [運行系統]
- JR東日本 青梅線
- JR東日本 五日市線
- JR東日本 八高線
- JR東日本 東北本線 [正式区間]
- JR東日本 京浜東北線 [運行系統]
- JR東日本 上野東京ライン [運行系統]
- JR東日本 東北本線 (尾久経由) [正式区間]
- JR東日本 宇都宮線・高崎線 (東京～大宮) [運行系統]
- JR東日本 埼京線 [運行系統]
- JR東日本 東北新幹線
- JR東日本 常磐線 [正式区間]
- JR東日本 常磐線快速 [運行系統]
- JR東日本 常磐線各駅停車 [運行系統]
- JR東日本 総武本線 [正式区間]
- JR東日本 総武線快速 [運行系統]
- JR東日本 総武本線 (総武緩行線) [正式区間]
- JR東日本 京葉線
- JR東海 東海道新幹線
- 国鉄 五日市線 (武蔵五日市～武蔵岩井) [廃]
- 国鉄 中央本線 (支線) [廃]
- 東武 伊勢崎線
- 東武 亀戸線
- 東武 大師線
- 東武 東上線
- 西武 池袋線
- 西武 新宿線
- 西武 西武園線
- 西武 国分寺線
- 西武 多摩湖線
- 西武 西武有楽町線
- 西武 豊島線
- 西武 拝島線
- 西武 多摩川線
- 西武 山口線
- 京成 本線
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