- JR九州 山陽本線 [運行系統]
- JR九州 鹿児島本線 (門司港～八代)
- JR九州 鹿児島本線 (川内～鹿児島)
- JR九州 香椎線
- JR九州 篠栗線
- JR九州 三角線
- JR九州 肥薩線
- JR九州 指宿枕崎線
- JR九州 長崎本線
- JR九州 長崎本線 (旧線)
- JR九州 唐津線
- JR九州 筑肥線 (姪浜～唐津)
- JR九州 筑肥線 (山本～伊万里)
- JR九州 佐世保線
- JR九州 大村線
- JR九州 久大本線
- JR九州 豊肥本線
- JR九州 日豊本線
- JR九州 日田彦山線 [運行系統]
- JR九州 日南線
- JR九州 吉都線
- JR九州 筑豊本線 (若松線) [運行系統]
- JR九州 筑豊本線 (福北ゆたか線) [運行系統]
- JR九州 筑豊本線 (原田線) [運行系統]
- JR九州 後藤寺線
- JR九州 宮崎空港線
- JR九州 九州新幹線
- JR九州 西九州新幹線
- JR九州 宮田線 [廃]
- JR九州 上山田線 [廃]
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